Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd6Q99JI4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd6Q99JI4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd6Q99JI4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms