Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec3Q99J72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec3Q99J72 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apobec3Q99J72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms