Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Riok1Q922Q2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Riok1Q922Q2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Riok1Q922Q2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok1Q922Q2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms