Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sf3b3Q921M3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b3Q921M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms