Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp4Q921I6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sh3bp4Q921I6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Sh3bp4Q921I6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Sh3bp4Q921I6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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