Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med28Q920D3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med28Q920D3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms