Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l1Q920A7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l1Q920A7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l1Q920A7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms