Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarca5Q91ZW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Smarca5Q91ZW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms