Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx18Q91ZR2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx18Q91ZR2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms