Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snapc2Q91XA5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snapc2Q91XA5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms