Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trub2Q91WG3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trub2Q91WG3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trub2Q91WG3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1037.7 ms