Protein–RNA interactions for Protein: Q91W97

Hkdc1, Putative hexokinase HKDC1, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hkdc1Q91W97 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hkdc1Q91W97 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hkdc1Q91W97 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hkdc1Q91W97 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms