Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csde1Q91W50 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csde1Q91W50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csde1Q91W50 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms