Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZgpatQ8VDM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZgpatQ8VDM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZgpatQ8VDM1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZgpatQ8VDM1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZgpatQ8VDM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZgpatQ8VDM1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms