Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alg12Q8VDB2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alg12Q8VDB2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms