Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sgip1Q8VD37 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgip1Q8VD37 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sgip1Q8VD37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sgip1Q8VD37 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms