Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd300ldQ8VCH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cd300ldQ8VCH2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300ldQ8VCH2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms