Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc58Q8R3Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc58Q8R3Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms