Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClmpQ8R373 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClmpQ8R373 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClmpQ8R373 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmpQ8R373 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClmpQ8R373 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClmpQ8R373 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClmpQ8R373 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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