Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gle1Q8R322 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gle1Q8R322 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms