Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2f4Q8R0K9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2f4Q8R0K9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2f4Q8R0K9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms