Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mkl1Q8K4J6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mkl1Q8K4J6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mkl1Q8K4J6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mkl1Q8K4J6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms