Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OptnQ8K3K8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.57■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.56■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
OptnQ8K3K8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms