Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccm2Q8K2Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccm2Q8K2Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms