Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stn1Q8K2X3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stn1Q8K2X3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stn1Q8K2X3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms