Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mtmr3Q8K296 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mtmr3Q8K296 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms