Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem17Q8K0U3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem17Q8K0U3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem17Q8K0U3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms