Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FgbQ8K0E8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FgbQ8K0E8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FgbQ8K0E8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms