Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CopaQ8CIE6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CopaQ8CIE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CopaQ8CIE6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 405.7 ms