Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rp1l1Q8CGM2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rp1l1Q8CGM2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1l1Q8CGM2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms