Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cdkl1Q8CEQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms