Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atad2Q8CDM1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atad2Q8CDM1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms