Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo43Q8CDI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo43Q8CDI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms