Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ufl1Q8CCJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ufl1Q8CCJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ufl1Q8CCJ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms