Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8CCC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8CCC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8CCC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CCC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8CCC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8CCC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8CCC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CCC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms