Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nhsl1Q8CAF4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nhsl1Q8CAF4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nhsl1Q8CAF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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