Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc15Q8C9M2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc15Q8C9M2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms