Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930504O13RikQ8C5Z9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930504O13RikQ8C5Z9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930504O13RikQ8C5Z9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms