Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd2Q8C561 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms