Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sit1Q8C503 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sit1Q8C503 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sit1Q8C503 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms