Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp44Q8C2S0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp44Q8C2S0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp44Q8C2S0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp44Q8C2S0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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