Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csgalnact2Q8C1F4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csgalnact2Q8C1F4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csgalnact2Q8C1F4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms