Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9b1Q8C0X2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9b1Q8C0X2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9b1Q8C0X2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9b1Q8C0X2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms