Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps6ka5Q8C050 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka5Q8C050 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms