Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actrt3Q8BXF8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt3Q8BXF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt3Q8BXF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt3Q8BXF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms