Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp38Q8BW70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp38Q8BW70 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp38Q8BW70 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp38Q8BW70 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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