Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx17Q8BVL3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx17Q8BVL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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