Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cep55Q8BT07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cep55Q8BT07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cep55Q8BT07 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms