Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sgsm1Q8BPQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sgsm1Q8BPQ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sgsm1Q8BPQ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sgsm1Q8BPQ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sgsm1Q8BPQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sgsm1Q8BPQ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sgsm1Q8BPQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sgsm1Q8BPQ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sgsm1Q8BPQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1490.3 ms