Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem87bQ8BKU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tmem87bQ8BKU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmem87bQ8BKU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms